新鮮糞便由進糞口進入第一池，池內糞便開始發(fā)酵分解、因比重不同糞液可自然分為三層，上層為糊狀糞皮，下層為塊狀或顆狀糞渣，中層為比較澄清的糞液。

在上層糞皮和下層糞渣中含細菌和寄生蟲卵最多，中層含蟲卵最少，初步發(fā)酵的中層糞液經過糞管溢流至第二池，而將大部分未經充分發(fā)酵的糞皮和糞渣阻留在第一池內繼續(xù)發(fā)酵。

流入第二他的糞液進一步發(fā)酵分解，蟲卵繼續(xù)下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產生的糞皮和糞厚度比第一池顯著減少。流人第三他的糞液一般已經腐熟，其中病菌和寄生蟲卵已基本殺滅。第三池功能主要起儲存已基本無害化的糞液作用。